一、品种混杂。在生产过程中，因操作不严格而混入其他稻种引起品种混杂，从而使香稻不香。防止措施是：香稻在晒种、药剂处理、浸种、催芽、播种、插秧等环节中，不得与其他品种混杂，育秧要一个品种一块田，同一块田起码要做好小田埂。收获时做到单打单晒单贮，并做好标签，避免人为混杂。

二、自然杂交。香稻品种与附近其他品种由于昆虫、风等传播花授，进行自然杂交，从而破坏品种的纯度，致使香稻品种退化，降低品质香味。防止办法的进行隔离留种。少量种子繁殖可用玻璃纸袋套在穗部，防止与其他品种杂交；大量繁殖种子时，应进行屏障隔离，或利用地形进行空间隔离，防止串粉杂交。

三、品种本身退化。生产上使用遗传性不太稳定的杂交新香稻品种，不良的环境条件、不当的栽培技术以及一个香稻品种在一个地区多年种植会使香稻品种不香。防止措施：一是香稻品种性状未稳定，不要随便引种，以免种植后香稻他离变异不香；二是种植香稻品种比其他品种更要讲究科学栽培，应做到配方施肥，科学管水，防治好病虫，促进植株健壮生长发育，减少植株因不良环境条件和不当的栽培措施而引起的退化；三是通过改变播种期留种和异地换种，来保持香稻品种特性。香稻倒播留种效果好。异地换种，可以避免由一个品种在一个地区连续种植多年而产生的品种混杂现象。

四、留种措施不当。没有专门的留种田，或大田生产的香稻随便留种，或虽有留种田，但去杂保纯不严，都会引起香稻品种混杂退化。因此，要特别重视香稻选种留种。应将留种田分离出来的变异劣株，在开花前及时除去。收割之前进行穗选或株选，选好的种子作明年留种田用，其余种子作大田生产用。