稻米的植株部分浸在水中时才长得最好。但水稻田中的氧气很快就会耗尽，使土壤中名为产甲烷生物的微生物不断增生，制造出大量甲烷。这样的结果是种植水稻的土地越多，这一地区释放的甲烷就越多。而甲烷是一种重要的温室气体。

实验发现，雨季稻田的甲烷释放量要高于旱季，但其中原因还不清楚。由于在雨季作物产量也会减少，因此荷兰瓦赫宁恩大学的研究人员设想，甲烷的生成量与作物的收成有关。通过实验他们发现，去除的花朵越多。这是因为，花少的植株储存光合作用生成的碳的能力较低。在这种情况下，碳转而被储存在土壤中，土壤中的细菌又将碳转化成甲烷，相反花越多（产量也高）的植株可储存的碳越多，从而使其不会流入土壤，成为产甲烷微生物的养料，从而使甲烷的释放量也会减少。

稻米生产所释放的甲烷目前约占全球甲烷释放量的13%。培育能储存更多碳的稻子品种会有助于减少甲烷的生成量。因此专家提出，应努力培育产量更高、适合农民种植、而且甲烷释放量较低的稻子。