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热激转录因子家族在水稻和拟南芥中的比较分析 |
作者:郭景康,吴坚,戢茜,等 |
出处: | 发布时间:2008-4-15 11:12:29 (原作发表时间:) |
热激转录因子(HSF)是生物体内调节热激反应应答的主要的转录因子。被子植物的两种模式生物水稻和拟南芥的基因组全序列已经测序完成,这些序列数据提供了极有价值的进行比较基因组分析的资源。对这两个物种中的热激转录因子家族进化关系的分析,对研究这一基因家族中各成员的功能有着重要的意义。研究组鉴定了22个拟南芥(Arabidopsis thaliana)和25个水稻(Orysa sativa japonica cultivar Nipponbare)的热激转录因子基因,它们代表了水稻和拟南芥中几乎所有的热激转录因子基因家族的成员。同时代表了热激转录因子基因家族在包括单子叶植物和双子叶植物的被子植物中的主要的进化谱系。在此基础上作了进化分析。在进化树的基础上把这47个转录因子分成三大类和六个同源基因组,鉴定出三个主要的直系同源类,这三个类中都包含有两个物种的热激转录因子成员。这表明了在被子植物的物种分化之前它们有共同的祖先。对系统发生树的进一步分析发现了一个可能的双子叶植物特异性的组。这些结果对水稻和拟南芥中热激转录因子家族的功能基因组的进一步研究提供了坚实的基础。推测了在热激转录因子基因的进化过程中的基因缺失和复制事件,还鉴定出9对旁系同源基因对,为研究水稻热激转录因子家族进化历史和水稻基因组进化提供证据。另外,还利用EST等数据统计了热激转录因子基因在水稻和拟南芥中的表达情况。通过分析表明,热激转录因子基因在这两种模式植物中被广泛的表达,这个结果进一步说明了该转录因子家族的重要性。
来源:遗传学报。2008 35 (2): 105-118。 (浏览次数:)
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