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正反向测序信息在全基因组序列拼接及分析中的应用
作者:韩玉军 等
出处:中国水稻信息网 发布时间:2004-12-27 14:55:48 (原作发表时间: )

    插入片段双末端正反向测序信息(double-barreled data,DB信息)已广泛应用于大基因组 测序组装项目。根据绘制籼稻全基因组工作框架图的经验,总结了DB信息在序列组装流程中的应用,同时,在原有基础上提出了改进的DB信息使用方法,包括基因组序列拼接、质量检验和重叠群的连接。此外,进一步提出了DB信息在下游数据分析过程中新的应用,包括利用DB信息获得基因组文库中每个克隆所包含的基因组片段的精确信息,以及在此基础上设计低成本全基因组基因芯片的一种基因芯片设计新方法。随着待测序物种的逐年增多,相信正反向测序信息在基因组测序组装工作,以及后续的基因组研究中将发挥越来越重要的作用。(图5表0参15)

    注:
    (1)文章来源:《中国科学C辑:生命科学》,2004年34卷第6期;
    (2)作者单位:北京大学生命科学学院 等。

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